RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CMIPQ8IY22 773 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMYD1Q8NB12 490 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HIPK4Q8NE63 616 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2T12Q8NG77 320 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NFKBIDQ8NI38 313 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF597Q96LX8 424 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAAR6Q96RI8 345 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UBQLN3Q9H347 655 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MKLN1Q9UL63 735 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERINC4A6NH21 518 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B2RBV5 119 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C5orf58C9J3I9 102 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H3BNH8 94 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACOT7O00154 380 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUV39H1O43463 412 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFB5O43674 189 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCO2O43819 266 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CBR3O75828 277 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP5HO75947 161 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DBIP07108 87 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THBS1P07996 1170 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NID1P14543 1247 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF24P17028 368 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A3Q00325 362 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCARB2Q14108 478 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGFBP1Q14512 234 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD226Q15762 336 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAPK14Q16539 360 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FXNQ16595 210 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIN52Q52LA3 116 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MARCH3Q86UD3 253 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT73Q86Y46 540 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIAH3Q8IW03 269 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PEX5LQ8IYB4 626 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FADS6Q8N9I5 356 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZG16BQ96DA0 208 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALG2Q9H553 416 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LUZP4Q9P127 313 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC42Q9Y546 428 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDHR4A6H8M9 788 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B4DXG7 233 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERPINB7O75635 380 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE9AO76083 593 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINGO3P0C6S8 592 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NPIPA8P0DM63 369 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSD17B1P14061 328 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACADSP16219 412 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL7RP16871 459 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSX1P28360 303 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKAR1BP31321 381 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PGM1P36871 562 aa7.44□□□□□ -1.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MASP1P48740 699 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms