RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427183.6

HDLBP-214, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HDLBP, Length 6,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-214ENST00000427183 ECHDC3Q96DC8 303 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 MICU1Q9BPX6 476 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 KCNK13Q9HB14 408 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 THSD1Q9NS62 852 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 TAS2R38P59533 333 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 SLC22A25Q6T423 547 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 SMOQ99835 787 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 PINK1Q9BXM7 581 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 H3BMQ9 156 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 FADS1O60427 444 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 KITLGP21583 273 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 SLC22A6Q4U2R8 563 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 OR5B2Q96R09 309 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 TYROBPO43914 113 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 OR4D1Q15615 310 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-214ENST00000427183 KDM8Q8N371 416 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 CACNA1SQ13698 1873 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.84□□□□□ -0.51
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HDLBP-214ENST00000427183 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
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