RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ALG9Q9H6U8 611 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CHST11Q9NPF2 352 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 INPP5EQ9NRR6 644 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 THSD1Q9NS62 852 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 POLKQ9UBT6 870 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IL36AQ9UHA7 158 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EVC2Q86UK5 1308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PRSS37A4D1T9 235 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PROB1E7EW31 1015 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RFXANKO14593 260 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RAB29O14966 203 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 P2RX6O15547 441 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HUS1O60921 280 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ENTPD5O75356 428 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RBBP9O75884 186 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 JTBO76095 146 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ERLIN2O94905 339 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DIRAS1O95057 198 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCNB2O95067 398 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STSP08842 583 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CT62P0C5K7 136 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PGCP20142 388 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PMCHP20382 165 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BCKDHBP21953 392 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 COMTP21964 271 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CD82P27701 267 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EPHA2P29317 976 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GNA11P29992 359 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HOXA9P31269 272 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BDKRB1P46663 353 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ART1P52961 327 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CLDN18P56856 261 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR2B6P58173 313 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 VBP1P61758 197 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NTHL1P78549 312 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPS2Q13227 327 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLAMF1Q13291 335 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SNCBQ16143 134 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DUSP6Q16828 381 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZNF284Q2VY69 593 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PTPN20Q4JDL3 420 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TP53I3Q53FA7 332 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPR107Q5VW38 600 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CYS1Q717R9 158 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MRGPREQ86SM8 312 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ITIH5Q86UX2 942 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C17orf64Q86WR6 236 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 STX12Q86Y82 276 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KMT5CQ86Y97 462 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PELI3Q8N2H9 469 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CNIH3Q8TBE1 160 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FANK1Q8TC84 345 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PIK3R3Q92569 461 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BADQ92934 168 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 NAT6Q93015 286 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ART4Q93070 314 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms