RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PITPNBP48739 271 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SRYQ05066 204 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZMYND11Q15326 602 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D20Q96BZ9 403 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5B2Q96R09 309 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOT7O00154 380 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 PET100P0DJ07 73 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 DNASE1P24855 282 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NR0B2Q15466 257 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF611Q8N823 705 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51E2Q9H255 320 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NLC8 198 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-25P63136 954 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF691Q5VV52 312 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LAS2Q8IYD9 372 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF740Q8NDX6 193 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SYT4Q9H2B2 425 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MEGF11A6BM72 1044 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 A6NIZ1 184 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEA12P43365 314 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RAP1BP61224 184 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RAP1AP62834 184 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP5O75197 1615 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 GFRA2O00451 464 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SYT7O43581 403 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM31Q5JXX7 168 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM205Q6UW68 189 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B7P16662 529 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNJ10P78508 379 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRJ-201ENST00000418331 BLACEA4D250 179 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 J3KTA2 159 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF806P0C7X5 589 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OPRL1P41146 370 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ERV3-1Q14264 604 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SFXN2Q96NB2 322 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA9P31269 272 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 DAP3P51398 398 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 LMF1Q96S06 567 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO10Q9HD67 2058 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 RP2O75695 350 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 TOXO94900 526 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CA5AP35218 305 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1Q1Q15612 314 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CDKN3Q16667 212 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPBD1B2RD01 187 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF35P13682 527 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CRHBPP24387 322 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CD40LGP29965 261 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 GLO1Q04760 184 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNEQ04844 493 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM205BPQ63HN1 556 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 BEND4Q6ZU67 534 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 SLCO2B1O94956 709 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPNS1P04632 268 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 ARNTP27540 789 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-201ENST00000418331 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms