RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	DPP10	Q8N608	796 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RAPGEF5	Q92565	580 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TSLP	Q969D9	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A0G2JMM0	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A1W2PPB8	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A1W2PPR1	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055		A0A1W2PRS3	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC188	H7C350	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SGK494	L7N484	410 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TXNDC9	O14530	226 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	P2RX6	O15547	441 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RDH16	O75452	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ANXA9	O76027	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	AP2A2	O94973	939 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	NKX2-2	O95096	273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SKIL	P12757	684 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	GABRA1	P14867	456 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SRD5A1	P18405	259 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	IL1RN	P18510	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	MAGEA5	P43359	124 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SSR4	P51571	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	GEM	P55040	296 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC26A5	P58743	744 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	FOXF2	Q12947	444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PTK6	Q13882	451 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	VEZF1	Q14119	521 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM53B	Q14153	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TMED2	Q15363	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPRK-210	ENST00000415055	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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