RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380176.7

PDLIM5-204, Transcript of PDZ and LIM domain 5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDLIM5, Length 3,098 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5-204ENST00000380176 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.4□□□□□ -1.23
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PDLIM5-204ENST00000380176 GPR151Q8TDV0 419 aa7.4□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 ASPNQ9BXN1 380 aa7.4□□□□□ -1.23
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PDLIM5-204ENST00000380176 PLD2O14939 933 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDLIM5-204ENST00000380176 AGR2O95994 175 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDLIM5-204ENST00000380176 KIR2DS5Q14953 304 aa7.39□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.39□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 RNLSQ5VYX0 342 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDLIM5-204ENST00000380176 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 LYPD3O95274 346 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 LALBAP00709 142 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 PDGFAP04085 211 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 THBS1P07996 1170 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 LIMS3P0CW19 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 LIMS4P0CW20 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 MAKP20794 623 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 IFNA8P32881 189 aa7.38□□□□□ -1.23
PDLIM5-204ENST00000380176 STAT5AP42229 794 aa7.38□□□□□ -1.23
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