RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GMNNO75496 209 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNA14O95837 355 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACTL6AO96019 429 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NMBP08949 121 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD8BP10966 210 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOSL2P15408 326 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSF2RAP15509 400 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BSGP35613 385 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR4P46093 362 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMAN1P49257 510 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNLIPRP2P54317 469 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DCDC1P59894 354 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERVK_113P61574 105 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RND3P61587 244 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HERVK_113P63132 956 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERVK-8P63133 956 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERVK-25P63136 954 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GUCY1A3Q02108 690 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PARP6Q2NL67 630 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEFB113Q30KQ7 82 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF678Q5SXM1 525 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DEPDC1Q5TB30 811 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IZUMO2Q6UXV1 221 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LANCL3Q6ZV70 420 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEACAM19Q7Z692 300 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGZQ86VD9 579 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR5BQ86VZ2 330 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFP82Q8N141 532 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELMOD1Q8N336 334 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPXM2Q8N436 756 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD2AQ8NA29 543 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEK11Q8NG66 645 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR7A2PQ8NGA2 310 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52N4Q8NGI2 321 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRGNQ92686 78 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P3H4Q92791 437 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTX4Q96A99 478 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGM2Q96G03 612 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF185Q96GF1 192 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C7orf26Q96N11 449 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF570Q96NI8 536 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CGRRF1Q99675 332 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AIFM2Q9BRQ8 373 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR18Q9BV38 432 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LMAN2LQ9H0V9 348 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIRPDQ9H106 197 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCG8Q9H221 673 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF167Q9H6Y7 350 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUBD1Q9UJT1 453 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APPL1Q9UKG1 709 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNJ2O15056 1496 aa-4.13□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PARD3Q8TEW0 1356 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0D9SFI3 127 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCRBV5S2A0A599 114 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf72A6NCS6 295 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM86B1E9PN63 330 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F5H5P2 479 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 J3QLI3 93 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCRL2O00421 344 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BET1O15155 118 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIAS1O75925 651 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HPRP00739 348 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JCHAINP01591 159 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUBB4AP04350 444 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CT62P0C5K7 136 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLFN14P0C7P3 912 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ODC1P11926 461 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRCP12931 536 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCAP28676 217 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MCM4P33991 863 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GALR1P47211 349 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ME1P48163 572 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP1A2P50993 1020 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEK4P51957 841 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LGALS3BPQ08380 585 aa-4.14□□□□□ -3.07
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP-4.14□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms