RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 VDAC3Q9Y277 283 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SLC22A20A6NK97 555 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ENO4A6NNW6 628 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD28O15084 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SEC14L5O43304 696 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 HCRTR2O43614 444 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CAPN3P20807 821 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MATN1P21941 496 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EPHA3P29320 983 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NXNQ6DKJ4 435 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OR2A2Q6IF42 318 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD46Q86W74 232 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SMPDL3BQ92485 455 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 APCP25054 2843 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KLF11O14901 512 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 AGR2O95994 175 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 UQCRC2P22695 453 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DLX5P56178 289 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NME5P56597 212 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 OCRLQ01968 901 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KIF18BQ86Y91 864 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SH3GL2Q99962 352 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EXD2Q9NVH0 621 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.51□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TNFRSF21O75509 655 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ME2P23368 584 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KIR2DL3P43628 341 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CPA2P48052 419 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ATP12AP54707 1039 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CD226Q15762 336 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF614Q8N883 585 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PIGMQ9H3S5 423 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MED17Q9NVC6 651 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF175Q9Y473 711 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 LRBAP50851 2863 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 HCFC1P51610 2035 aa14.5□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 C7orf72A4D263 438 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SCN2BO60939 215 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NUDT14O95848 222 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CRHP06850 196 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 NPIPA8P0DM63 369 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FCGR2AP12318 317 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 IDO1P14902 403 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 UFM1P61960 85 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FOXF2Q12947 444 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SGCBQ16585 318 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 KLHL26Q53HC5 615 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 ARL8AQ96BM9 186 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC115Q96NT0 180 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PINK1Q9BXM7 581 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 FBN2P35556 2912 aa14.49□□□□□ -0.09
ATG4B-201ENST00000344376 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms