RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SHBQ15464 509 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 HSDL2Q6YN16 418 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 MFSD4AQ8N468 514 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 NT5DC2Q9H857 520 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 C17orf51A8MQB3 221 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 STX11O75558 287 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 APOA1P02647 267 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ITGA2P17301 1181 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ARPC4P59998 168 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 KCNC4Q03721 635 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CHAF1BQ13112 559 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CDK5R2Q13319 367 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 DECR1Q16698 335 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ART5Q96L15 291 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ATRXP46100 2492 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PEPDP12955 493 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 DCTP40126 519 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 IFITM2Q01629 132 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 TAB1Q15750 504 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 NEURL3Q96EH8 262 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 IFT52Q9Y366 437 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 KCNK2O95069 426 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 EPHA2P29317 976 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 IL20RBQ6UXL0 311 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ZAR1Q86SH2 424 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 AIREO43918 545 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 ARAFP10398 606 aa14.73□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 PRPH2P23942 346 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 LACC1Q8IV20 430 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 VNN3Q9NY84 501 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PLD2O14939 933 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CTNSO60931 367 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CCNB2O95067 398 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 C7P10643 843 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PRG2P13727 222 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 TGIF1Q15583 401 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ADAMDEC1O15204 470 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 RGS10O43665 173 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 CSO75390 466 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 UGT2B15P54855 530 aa14.72□□□□□ -0.05
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PDGFB-201ENST00000331163 SMUG1Q53HV7 270 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 MED25Q71SY5 747 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SCDO00767 359 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PCGF2P35227 344 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 Q96MT0 163 aa14.72□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.72□□□□□ -0.05
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