RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 TMEM5Q9Y2B1 443 aa23.56■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 AIFM1O95831 613 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NDUFV2P19404 249 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CAMK2DQ13557 499 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 COMMD7Q86VX2 200 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GPR34Q9UPC5 381 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SATB2Q9UPW6 733 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DAPL1A0PJW8 107 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ERI3O43414 337 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CLUP10909 449 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DRD2P14416 443 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DRD5P21918 477 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CLCNKAP51800 687 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DECR1Q16698 335 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 IZUMO1Q8IYV9 350 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NUP43Q8NFH3 380 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NXPE3Q969Y0 559 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NLGN3Q9NZ94 848 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.55■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SYT5O00445 386 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CDK2AP1O14519 115 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PAICSP22234 425 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 BCL6P41182 706 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SLC16A1P53985 500 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NTHL1P78549 312 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GNA13Q14344 377 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SFTPA1Q8IWL2 248 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ABHD4Q8TB40 342 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DOK4Q8TEW6 326 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CACNG6Q9BXT2 260 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GPR171O14626 319 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GPR139Q6DWJ6 353 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 TMEM65Q6PI78 240 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 TOMM5Q8N4H5 51 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 FBXL4Q9UKA2 621 aa23.54■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 HPXP02790 462 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CERS1P27544 350 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ZP1P60852 638 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GSG1Q2KHT4 349 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 CD276Q5ZPR3 534 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 LILRA6Q6PI73 481 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 TMEM64Q6YI46 380 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PFN4Q8NHR9 129 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GIMAP1Q8WWP7 306 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SLC35A4Q96G79 324 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 OR52D1Q9H346 318 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 OR7A10O76100 309 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PRG2P13727 222 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SLC9A5Q14940 896 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GANCQ8TET4 914 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 THAP4Q8WY91 577 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 RBP7Q96R05 134 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 OR51V1Q9H2C8 321 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MED17Q9NVC6 651 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ENTPD4Q9Y227 616 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa23.53■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 WNT1P04628 370 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 IL9P15248 144 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MAKP20794 623 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NOS3P29474 1203 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 OR12D2P58182 307 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SNTA1Q13424 505 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 C16orf62Q7Z3J2 963 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 RFLNBQ8N5W9 214 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ACOT4Q8N9L9 421 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SLC16A11Q8NCK7 471 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PTP4A1Q93096 173 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 G3V3Q6 166 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 J3QLW9 94 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 HRGP04196 525 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 ZNF19P17023 458 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 GALP22466 123 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 SELENOPP49908 381 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 PYHIN1Q6K0P9 492 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 LSMEM1Q8N8F7 131 aa23.52■■□□□ 1.36
SENP3-201ENST00000321337 POF1BQ8WVV4 589 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms