RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TAS2R31P59538 309 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TAS2R20P59543 309 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ZNF695Q8IW36 515 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 OR4C15Q8NGM1 316 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 BTBD2Q9BX70 525 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.93□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 DVL2O14641 736 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 KCNE1P15382 129 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 LIPAP38571 399 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 GPR37L1O60883 481 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 RAB3AP20336 220 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TM4SF1P30408 202 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CLDN12P56749 244 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SDSLQ96GA7 329 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 HINT2Q9BX68 163 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 GGT3PA6NGU5 568 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ANKRD28O15084 1053 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 HTR3BO95264 441 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TCRBP04435 133 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TMEM225BP0DP42 221 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PTGER1P34995 402 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 GDNFP39905 211 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ARHGAP1Q07960 439 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PGAP1Q75T13 922 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 MAVSQ7Z434 540 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SULT1B1O43704 296 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 AKR1C1Q04828 323 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SGCZQ96LD1 299 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ARNTLO00327 626 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PIRO00625 290 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ACOT8O14734 319 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TRIM23P36406 574 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CTRCQ99895 268 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PIGAP37287 484 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 TRAPPC6AO75865 159 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 INAVAQ3KP66 663 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 HACD4Q5VWC8 232 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 GPR148Q8TDV2 347 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PRRT1Q99946 306 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 S100A11P31949 105 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ZNF559Q9BR84 538 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 LUZP4Q9P127 313 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 SYT7O43581 403 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 RANBP10Q6VN20 620 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CBLL1Q75N03 491 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 FAM122BQ7Z309 247 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 CD200R1Q8TD46 325 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 C14orf79Q96F83 325 aa14.91□□□□□ -0.02
MSI2-201ENST00000284073 EGLN2Q96KS0 407 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms