RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 ABCA1O95477 2261 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 GCH1P30793 250 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ETV6P41212 452 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 MSMO1Q15800 293 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ZNF546Q86UE3 836 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TEX19Q8NA77 164 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SYNPRQ8TBG9 265 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RIMS3Q9UJD0 308 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 NENFQ9UMX5 172 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 BMP2P12643 396 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SELENOWP63302 87 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CDK5R2Q13319 367 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 LCN10Q6JVE6 187 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TMEM135Q86UB9 458 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 NRMQ8IXM6 262 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OR4K5Q8NGD3 323 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CKAP5Q14008 2032 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TNFSF12O43508 249 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TK1P04183 234 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SPINT3P49223 89 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PQLC3Q8N755 202 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RNF39Q9H2S5 420 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.8□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 GLSO94925 669 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 BMP4P12644 408 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 DDCP20711 480 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OPRL1P41146 370 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 STEAP4Q687X5 459 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 IQCF1Q8N6M8 205 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OR7G1Q8NGA0 311 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SCAMP4Q969E2 229 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SGK3Q96BR1 496 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 GPR160Q9UJ42 338 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RARRES3Q9UL19 164 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 C20orf202A1L168 122 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 FANCGO15287 622 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PKLRP30613 574 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OTX2P32243 289 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 HMGN3Q15651 99 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CHTF18Q8WVB6 975 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SLAMF9Q96A28 289 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 EGFP01133 1207 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CAPNS1P04632 268 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 LMAN2Q12907 356 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 NFATC4Q14934 902 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 COMMD6Q7Z4G1 85 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 LAMA4Q16363 1823 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CDHR4A6H8M9 788 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 OR6C65A6NJZ3 312 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 UGDHO60701 494 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RDH16O75452 317 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 S1PR4O95977 384 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TP53P04637 393 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 MMP2P08253 660 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 AAK1Q2M2I8 961 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PINK1Q9BXM7 581 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RABIFP47224 123 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 CDKN2DP55273 166 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RNF4P78317 190 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 UPP1Q16831 310 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 C14orf80Q86SX3 495 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 FAM217AQ8IXS0 508 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 SFTPDP35247 375 aa10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
THBS1-201ENST00000260356 UBA52P62987 128 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms