RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Col4a5Q63ZW6 1691 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Phf11cB4XVP9 339 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mthfd2lD3YZG8 338 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm17555F6U8B9 371 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rnpepl1G5E872 720 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Man2b2O54782 1018 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 CaskO70589 926 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Adra2bP30545 450 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cnr2P47936 347 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 BcheQ03311 603 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrfn1Q2WF71 766 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 ShhQ62226 437 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp3r1Q63810 170 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 BC061237Q6P8I2 184 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Carns1Q6ZPS2 827 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Eci3Q78JN3 317 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tas2r106Q7M724 308 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr699Q7TRN3 316 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Psmf1Q8BHL8 271 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Leng9Q8BTN6 485 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 PigtQ8BXQ2 582 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 NdnfQ8C119 568 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr340Q8VGL0 312 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Acsm1Q91VA0 573 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rgs19Q9CX84 216 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Naalad2Q9CZR2 740 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mfsd1Q9DC37 464 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 NpvfQ9ESQ8 188 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Aqp9Q9JJJ3 295 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tinf2Q9QXG9 341 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2afb3S4R1G7 115 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1432A0A140LHS7 346 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1206A2ATJ9 307 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr640E9Q7P5 314 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr172E9Q8F6 309 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il20rbE9Q9A6 308 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1513L7N457 313 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 RradO88667 308 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 FhitO89106 150 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mapk14P47811 360 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Acod1P54987 488 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hcrtr2P58308 460 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 SgcbP82349 320 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Serpinf1P97298 417 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bop1P97452 732 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mmp7Q10738 264 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dtx3lQ3UIR3 748 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr463Q5SW49 311 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr462Q5SW50 311 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc23a3Q60850 611 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clcn4Q61418 747 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pan3Q640Q5 837 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scgb1c1Q7M742 95 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Med26Q7TN02 588 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp184Q7TSH9 737 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gpr176Q80WT4 515 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Amigo2Q80ZD9 519 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam180aQ8BR21 173 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 MdficQ8BX65 247 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dpep2Q8C255 478 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Shisa7Q8C3Q5 558 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr478Q8VG04 314 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Capn8Q91VA3 703 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wdr45Q91VM3 360 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mgat2Q921V5 442 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 SmoxQ99K82 555 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rnf151Q9CQ29 239 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 4931417E11RikQ9CR05 305 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sec23bQ9D662 767 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Entpd4Q9DBT4 613 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clca3a2Q9EQR4 902 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prl3c1Q9QUN5 212 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hsd17b6Q9R092 317 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scn10aQ6QIY3 1958 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1223A0A1L1SU13 311 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 C6E9Q6D8 931 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm6882J3KMT3 313 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc6a18O88576 615 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il13P20109 131 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bmp7P23359 430 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hoxc11P31313 304 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hsf2P38533 535 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sesn1P58006 492 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Il11ra2P70225 432 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 OxtrP97926 388 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mtf1Q07243 675 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 SctQ08535 133 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 CtrcQ3SYP2 268 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mccc2Q3ULD5 563 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm10662Q3UT86 313 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc5a6Q5U4D8 634 aa6.63□□□□□ -1.35
Trps1-201ENSMUST00000077935 Klra2Q60660 288 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.9 ms