RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MrgprdQ91ZB8 321 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smc6Q924W5 1097 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk9Q99J95 372 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q99KU6 348 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb1Q9CPU1 170 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hrasls5Q9CPX5 270 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znhit3Q9CQK1 151 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NplQ9DCJ9 320 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r52Q9EP79 309 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trappc4Q9ES56 219 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il22Q9JJY9 179 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dok3Q9QZK7 444 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnpdlQ9Z130 301 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armcx4E9PWM3 2356 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flg2Q2VIS4 2362 aa10.16□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FcgbpE9Q0B5 2583 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv12-38A0A0G2JEI7 115 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd300ld4A2A7W1 245 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20489A2AGH5 449 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MsmpB1AWI6 139 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Macc1E9PXX8 851 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp108E9Q8I5 642 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r69G3XA45 850 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1425K7N659 312 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde9aO70628 534 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp14P10755 501 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camk2aP11798 478 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpp4P28843 760 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc1a5P51912 553 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hrh3P58406 445 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gnb5P62881 395 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vipr1P97751 459 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UngP97931 306 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galnt1Q09200 533 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 G430049J08RikQ3TL09 166 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ulk3Q3U3Q1 472 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnga4Q3UW12 575 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrc3Q5DU56 1064 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra8Q60682 266 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyb561Q60720 250 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SordQ64442 357 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim46Q7TNM2 759 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pknox2Q8BG99 474 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan12Q8BKT6 305 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IlvblQ8BU33 632 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl31Q8BWA5 634 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OlahQ8R197 265 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1424Q8VFV1 313 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr935Q8VG16 308 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1426Q8VG74 311 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc3a1Q91WV7 685 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ChiaQ91XA9 473 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taar1Q923Y8 332 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PsphQ99LS3 225 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdca5Q9CPY3 264 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fis1Q9CQ92 152 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifrd2Q9D8U0 441 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc19a2Q9EQN9 498 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrac1Q9JKP8 129 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r119Q9JKT2 335 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnj10Q9JM63 379 aa10.15□□□□□ -0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PolqQ8CGS6 2544 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp993A2A8V4 313 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp992B1ASD8 573 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hs3st4D3YVV6 449 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r47K7N709 852 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akap10O88845 662 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01667 111 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpx3P46412 226 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sat1P48026 171 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r7P59530 312 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nkx3-1P97436 237 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd36Q08857 472 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plpp5Q3UMZ3 260 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem171Q4KL18 322 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frg2f1Q6P3A2 227 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapre3Q6PER3 281 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fpr-rs7Q71MR7 338 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syt16Q7TN83 639 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhdc1Q80YG3 406 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk3Q80YP0 303 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat4bQ812F8 548 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd8Q8BH31 519 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss27Q8BJR6 328 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AntxrlQ8BVM2 641 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reep4Q8K072 257 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp991Q8R1N3 573 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr536Q8VFE9 307 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptgr1Q91YR9 329 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35a4Q9D321 324 aa10.14□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hapln2Q9ESM3 341 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.8 ms