RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 EMCNQ9ULC0 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 A8MXE2 369 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 NFKBIEO00221 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 AHSA1O95433 338 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CD63P08962 238 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CD3GP09693 182 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SOX2P48431 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MLLT10P55197 1068 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PER3P56645 1201 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R19P59542 299 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SLAMF1Q13291 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CD163Q86VB7 1156 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 KCT2Q8NC54 265 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ASB13Q8WXK3 278 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 C14orf79Q96F83 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SMOQ99835 787 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CDHR4A6H8M9 788 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SLC31A1O15431 190 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PDYNP01213 254 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SYPP08247 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HCKP08631 526 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ACP5P13686 325 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ACRV1P26436 265 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HNF1BP35680 557 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 WASP42768 502 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 AGTR2P50052 363 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 OSTM1Q86WC4 334 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 GRHL3Q8TE85 626 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SFXN2Q96NB2 322 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SYT3Q9BQG1 590 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ALG8Q9BVK2 526 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PELI2Q9HAT8 420 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 F10P00742 488 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 UBL4AP11441 157 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MTNR1BP49286 362 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MEOX2P50222 304 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 RAB13P51153 203 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 RAB1AP62820 205 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TNFRSF17Q02223 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 EVX2Q03828 476 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 GPR157Q5UAW9 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 NAA40Q86UY6 237 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM163Q8TC26 289 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ASB6Q9NWX5 421 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 RASD1Q9Y272 281 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 PEX10O60683 326 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 S1PR4O95977 384 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TGFB1P01137 390 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HEXBP07686 556 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 ITGA5P08648 1049 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 HOXB2P14652 356 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 BPIP17213 487 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 21.9
CLCN3-211ENST00000613795 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 GPR143P51810 404 aa6.5□□□□□ -1.37
CLCN3-211ENST00000613795 CDK3Q00526 305 aa6.5□□□□□ -1.37
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