RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ACADVLP49748 655 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS4P49798 205 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP15P51511 669 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCNKAP51800 687 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN15P56746 228 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PROK1P58294 105 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL26P61254 145 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A9P82251 487 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 XIAPP98170 497 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GALK2Q01415 458 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L1Q07817 233 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXF2Q12947 444 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LCP2Q13094 533 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PEX6Q13608 980 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NPTX1Q15818 432 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF19Q2TAC6 998 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC50Q53HI1 259 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSL3PQ5NE16 218 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 REP15Q6BDI9 236 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM166AQ6J272 317 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 IRGCQ6NXR0 463 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LINGO4Q6UY18 593 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R42Q7RTR8 314 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD46Q86W74 232 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 COMMD2Q86X83 199 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP8Q8NA92 274 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CD200R1Q8TD46 325 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DDI1Q8WTU0 396 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PROX1Q92786 737 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 WBP2Q969T9 261 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM46BQ96A09 425 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RCN3Q96D15 328 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MOCOSQ96EN8 888 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 C19orf60Q96EN9 201 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LINGO1Q96FE5 620 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR21Q99679 349 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 YY1AP1Q9H869 796 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR41Q9HAD4 459 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 S100A14Q9HCY8 104 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FZD3Q9NPG1 666 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NGBQ9NPG2 151 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT4Q9NZJ9 180 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 POMPQ9Y244 141 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC42Q9Y546 428 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PLXNA2O75051 1894 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.85□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPK3Q96L96 1907 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YYE9 177 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQ67 120 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 hDV102S1A0JD36 115 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 VGLL3A8MV65 326 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM10O14672 748 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 MRASO14807 208 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD51BO15315 384 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CFLARO15519 480 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR137BO60478 399 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK14O94921 469 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6B1O95007 311 aa3.84□□□□□ -1.79
CAPNS1-210ENST00000590211 DIRAS3O95661 229 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms