RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		Q9N2J8	555 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NGB	Q9NPG2	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087WZY1	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A0A096LNT2	108 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C7orf72	A4D263	438 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169		A8MT66	165 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GMFG	O60234	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GPRIN2	O60269	458 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CD8A	P01732	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OPN1LW	P04000	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	COL6A2	P12110	1019 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GSTM5	P46439	218 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CLC	Q05315	142 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FAP	Q12884	760 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RASA2	Q15283	850 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	APIP	Q96GX9	242 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM2	Q9C040	744 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HHATL	Q9HCP6	504 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TNFSF11	O14788	317 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ULK1	O75385	1050 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	FES	P07332	822 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DDC	P20711	480 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	IL32	P24001	234 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GABRA3	P34903	492 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RFX3	P48380	749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HTR6	P50406	440 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C2orf54	Q08AI8	447 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	UNC50	Q53HI1	259 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM107	Q6UX40	140 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	OSTF1	Q92882	214 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RNF145	Q96MT1	663 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF382	Q96SR6	550 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF4-238	ENST00000568169	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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