RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	HCRTR2	O43614	444 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TYROBP	O43914	113 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GMFG	O60234	142 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TBX19	O60806	448 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CTAG2	O75638	210 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SLITRK5	O94991	958 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZWINT	O95229	277 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	UTS2	O95399	124 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NEFH	P12036	1026 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	BCKDHA	P12694	445 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CAPN3	P20807	821 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	EPHA1	P21709	976 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CTSS	P25774	331 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GABRA3	P34903	492 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KRT20	P35900	424 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ETV4	P43268	484 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KIR2DL3	P43628	341 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RCAN2	Q14206	197 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PTGR1	Q14914	329 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DECR1	Q16698	335 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MARCH3	Q86UD3	253 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CNPY4	Q8N129	248 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC01560	Q8TB33	94 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CAVIN3	Q969G5	261 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PPCDC	Q96CD2	204 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TRMO	Q9BU70	441 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	C1orf50	Q9BV19	199 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		Q9N2J8	555 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NTM	Q9P121	344 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MID2	Q9UJV3	735 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304		A6NNC1	897 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ITM2A	O43736	263 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PEX11A	O75192	247 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFSF13	O75888	250 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NKX2-2	O95096	273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RCBTB2	O95199	551 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	BPGM	P07738	259 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	FGF4	P08620	206 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IFI6	P09912	130 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LAMP1	P11279	417 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PRPS2	P11908	318 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	HK1	P19367	917 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CHM	P24386	653 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NOS3	P29474	1203 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DGKQ	P52824	942 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PRKAG1	P54619	331 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CLDN20	P56880	219 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	PSPH	P78330	225 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF844	Q08AG5	666 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DUSP5	Q16690	384 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	RAET1L	Q5VY80	246 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	WDR93	Q6P2C0	686 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	VWA1	Q6PCB0	445 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SZRD1	Q7Z422	152 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LUZP2	Q86TE4	346 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GATS	Q8NAP1	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	NUP43	Q8NFH3	380 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	GPR151	Q8TDV0	419 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ZEB1-223	ENST00000561304	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		6.68	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms