RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 INIPQ9NRY2 104 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM140Q9NV12 185 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GPR83Q9NYM4 423 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TAS2R9Q9NYW1 312 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IL36AQ9UHA7 158 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DPP7Q9UHL4 492 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RAB23Q9ULC3 237 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 STUB1Q9UNE7 303 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SNX7Q9UNH6 387 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IFT52Q9Y366 437 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.13□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FAM172BPA6NC97 362 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CCDC182A6NF36 153 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 UNC119BA6NIH7 251 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 WASH3PC4AMC7 463 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ARHGEF9O43307 516 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CHST10O43529 356 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC28A2O43868 658 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR10H3O60404 316 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SH3BGRLO75368 114 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NME6O75414 186 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLCO2B1O94956 709 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SEMA3DO95025 777 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC16A8O95907 504 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PTHP01270 115 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IGLV2-14P01704 120 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GSTT2P0CG29 244 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GSTT2BP0CG30 244 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CPEP16870 476 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GSTM3P21266 225 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IDSP22304 550 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CBLP22681 906 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 KELP23276 732 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 IMPA1P29218 277 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SDC2P34741 201 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 LIPAP38571 399 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 ETV6P41212 452 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 XCR1P46094 333 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 OR1E2P47887 323 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 XKP51811 444 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SMSP52788 366 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MAPK12P53778 367 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CRISP1P54107 249 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TAS2R50P59544 299 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 BNC1Q01954 994 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SCN1BQ07699 218 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MGAT2Q10469 447 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 PDE7AQ13946 482 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 GANABQ14697 944 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 QPRTQ15274 297 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 INAVAQ3KP66 663 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 BCL7AQ4VC05 210 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 LRRC73Q5JTD7 316 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 AGAP6Q5VW22 663 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLX4IPQ5VYV7 408 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 TRIQKQ629K1 86 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 MZT2AQ6P582 158 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DEF8Q6ZN54 512 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 C17orf64Q86WR6 236 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NUDT13Q86X67 352 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RNF130Q86XS8 419 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 NAGSQ8N159 534 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 C10orf111Q8N326 155 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 METTL4Q8N3J2 472 aa4.12□□□□□ -1.75
ATXN3-241ENST00000556374 RNF175Q8N4F7 328 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms