RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	C12orf49	Q9H741	205 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	EQTN	Q9NQ60	294 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.24	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0J9YW62	118 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA8R	I6L899	631 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFSF11	O14788	317 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNH1	O95259	989 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	AGTR1	P30556	359 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	MAP3K8	P41279	467 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	HSPB3	Q12988	150 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO30	Q8TB52	745 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR151	Q8TDV0	419 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A087WZY1	265 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1W2PRB8	838 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	C7orf72	A4D263	438 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC151	A5D8V7	595 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OVOL3	O00110	214 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFB5	O43674	189 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TMCC2	O75069	709 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NKX2-2	O95096	273 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SYNGR4	O95473	234 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NTN1	O95631	604 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SOD3	P08294	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SHC1	P29353	583 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	VEZF1	Q14119	521 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TSC22D1	Q15714	1073 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	IMPG1	Q17R60	797 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NEUROG1	Q92886	237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	MED17	Q9NVC6	651 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		11.22	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBB	P07437	444 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	NGFR	P08138	427 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	IFI6	P09912	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ACP2	P11117	423 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPS2	P11908	318 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	RAC1	P63000	192 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	DMTN	Q08495	405 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	CPTP	Q5TA50	214 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LETMD1-231	ENST00000551931	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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