RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 LRRC72A6NJI9 287 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 C2orf74A8MZ97 194 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PLD2O14939 933 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 RGS5O15539 181 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 STX11O75558 287 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 NID1P14543 1247 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 AKT2P31751 481 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 MAP3K8P41279 467 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 TPTEP56180 551 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 MAP4K2Q12851 820 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 GPR18Q14330 331 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 COL26A1Q96A83 441 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 POLE3Q9NRF9 147 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 SEC14L5O43304 696 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRO-208ENST00000542557 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRO-208ENST00000542557 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRO-208ENST00000542557 H0YGG7 62 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 CYR61O00622 381 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRO-208ENST00000542557 NTN1O95631 604 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 GPR75O95800 540 aa6.09□□□□□ -1.44
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PTPRO-208ENST00000542557 HTR2AP28223 471 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 ACSL1P33121 698 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 TPMTP51580 245 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 LBX1P52954 281 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 ADAM15Q13444 863 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 RAB30Q15771 203 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRO-208ENST00000542557 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.09□□□□□ -1.44
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