RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA0232Q92628 1395 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 LRIT2A6NDA9 550 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PANO1I0J062 215 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PDLIM1O00151 329 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 SYNGR4O95473 234 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF853P0CG23 659 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF17P17021 662 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF18P17022 549 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 SDC1P18827 310 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 SLC26A2P50443 739 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 SGSHP51688 502 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 KIAA1024LP59773 190 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 BCL2L1Q07817 233 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PSG7Q13046 419 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF674Q2M3X9 581 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 OTPQ5XKR4 325 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TM2D1Q9BX74 207 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 HES7Q9BYE0 225 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 HPS4Q9NQG7 708 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 MIOXQ9UGB7 285 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 FKBP7Q9Y680 259 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa2.79□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PINLYPA6NC86 204 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 WWP2O00308 870 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 OR7A17O14581 309 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV3-23P01764 117 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 FUT3P21217 361 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 MUTP22033 750 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TMOD1P28289 359 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 NF2P35240 595 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RBMXP38159 391 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RIPPLY3P57055 190 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 RAB35Q15286 201 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 CAMK4Q16566 473 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 IYDQ6PHW0 289 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 C9orf40Q8IXQ3 194 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ENTHD1Q8IYW4 607 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM45BQ96B21 275 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN18Q96SJ8 248 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 GLT8D2Q9H1C3 349 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 CARD9Q9H257 536 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 Q9H3A6 140 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 EHD1Q9H4M9 534 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 LHX3Q9UBR4 397 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 DHRS7Q9Y394 339 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 DLEC1Q9Y238 1755 aa2.78□□□□□ -1.96
CPEB4-210ENST00000522344 CD163L1Q9NR16 1453 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 TIAM2Q8IVF5 1701 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM49D1C9J1S8 452 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 H3BMH7 237 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF254O75437 659 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 PGK2P07205 417 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 NR2C1P13056 603 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 CYP11B1P15538 503 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 RFC2P35250 354 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 CASP9P55211 416 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 HERPUD1Q15011 391 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 SBK1Q52WX2 424 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA46Q5T0L3 261 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC91Q7Z6B0 441 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 OR10H4Q8NGA5 316 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 PSMA8Q8TAA3 256 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 EBF4Q9BQW3 602 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 ABCG8Q9H221 673 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM245Q9H330 911 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 MYOZ2Q9NPC6 264 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 ELOVL2Q9NXB9 296 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 NEU3Q9UQ49 428 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 SCN11AQ9UI33 1791 aa2.77□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.76□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa2.76□□□□□ -1.97
CPEB4-210ENST00000522344 USP6P35125 1406 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms