RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515838.2

RBM4-209, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 2

Gene RBM4, Length 943 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-209	ENST00000515838	FOSL1	P15407	271 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CPOX	P36551	454 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CD79B	P40259	229 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SEC14L5	O43304	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	KCNK2	O95069	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ATE1	O95260	518 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ME2	P23368	584 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PRKAG1	P54619	331 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PON3	Q15166	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SGCB	Q16585	318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PGM2	Q96G03	612 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PIGU	Q9H490	435 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838		A0A1W2PRB8	838 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838		H3BNH8	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CHRNG	P07510	517 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ACP2	P11117	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	PPP3CB	P16298	524 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ELK4	P28324	431 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CLDN15	P56746	228 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CLDN20	P56880	219 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	C21orf58	P58505	322 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	RAC1	P63000	192 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	DUSP5	Q16690	384 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CPTP	Q5TA50	214 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	APOOL	Q6UXV4	268 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	OR4C3	Q8NH37	302 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	FIG4	Q92562	907 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-209	ENST00000515838	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26

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