RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 REG3GQ6UW15 175 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF329Q86UD4 541 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 PHC2Q8IXK0 858 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO32Q969P5 355 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 C12orf66Q96MD2 445 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A7Q99884 636 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 HYPKQ9NX55 129 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1B-205ENST00000514178 HMGXB3Q12766 1538 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PNV4 684 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 XKRY2A2RUG3 117 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR7A17O14581 309 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IGFBP5P24593 272 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FGL1Q08830 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 PEX6Q13608 980 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 DCST2Q5T1A1 773 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NT5C3BQ969T7 300 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf34Q96L11 122 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP16Q9BY84 665 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 AMBNQ9NP70 447 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SMOXQ9NWM0 555 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1B0GTH9 108 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV3-20P01619 116 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 GDI1P31150 447 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 GNPDA1P46926 289 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 AP3M2P53677 418 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 MESDQ14696 234 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LGSNQ5TDP6 509 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IFNEQ86WN2 208 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 C18orf12Q96KH6 178 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 AGAP3Q96P47 875 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.2□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC01565O15544 149 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TSC22D2O75157 780 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SERPINA3P01011 423 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 IL18R1Q13478 541 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ERICH1Q86X53 443 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00479Q96M42 142 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 C9orf85Q96MD7 179 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC61Q9BV99 259 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CDH9Q9ULB4 789 aa6.19□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NOTCH4Q99466 2003 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 H0Y8G0 127 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 MSH4O15457 936 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 H2BFMP0C1H6 154 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 NPIPA8P0DM63 369 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTR3P61158 418 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 BEX3Q00994 111 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.18□□□□□ -1.42
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms