RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 CNPY1Q3B7I2 92 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 OR4K5Q8NGD3 323 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ARMC7Q9H6L4 198 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 C14orf105Q9NVL8 296 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 CFL2Q9Y281 166 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 THY1P04216 161 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 CCL4P13236 92 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 PRG2P13727 222 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 CD59P13987 128 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 CDK5R2Q13319 367 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 TRAM2Q15035 370 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF141Q15928 474 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 LINC00471Q8N535 108 aa24.06■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 LCN10Q6JVE6 187 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 CNIH3Q8TBE1 160 aa24.06■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.06■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 LMF1Q96S06 567 aa24.06■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 AGXTP21549 392 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 37.6
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC38A4Q969I6 547 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 A0A087WUU8 490 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 TRIM64CA6NLI5 447 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 IDSB3KWA1 339 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF806P0C7X5 589 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 ZER1Q7Z7L7 766 aa24.05■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 HTR2AP28223 471 aa24.04■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 AASSQ9UDR5 926 aa24.04■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 HLCSP50747 726 aa24.03■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 OSMP13725 252 aa24.03■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 CHMP24386 653 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 GSSP48637 474 aa24.03■■□□□ 1.44
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HOXB3-212ENST00000498678 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 EBPQ15125 230 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 DECR1Q16698 335 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 C1orf94Q6P1W5 598 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF554Q86TJ5 538 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HOXB3-212ENST00000498678 EVA1AQ9H8M9 152 aa24.03■■□□□ 1.44
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