RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 GATSQ8NAP1 163 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 OR2T11Q8NH01 316 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FBXO30Q8TB52 745 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 APOPT1Q96IL0 206 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PPP3R2Q96LZ3 170 aa18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ALG1L2C9J202 215 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF9O43307 516 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CTIFO43310 598 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NPHS1O60500 1241 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 IGKV1D-16P01601 117 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 TBXA2RP21731 343 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ME2P23368 584 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 LCN1P31025 176 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 UGT2B10P36537 528 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZNF385BQ569K4 471 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB8AQ96BR9 441 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FCRL1Q96LA6 429 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 UBQLN4Q9NRR5 601 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 TRAF6Q9Y4K3 522 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.13■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 LSM1O15116 133 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 KCNK2O95069 426 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NGFRP08138 427 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ACP2P11117 423 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.491e-17■■□□□ 12.5
ACTB-212ENST00000484841 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SHEQ5VZ18 495 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 APOOLQ6UXV4 268 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 P3H2Q8IVL5 708 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SLC16A11Q8NCK7 471 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 OR4C3Q8NH37 302 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PIGTQ969N2 578 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.12■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PRB8 838 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FGF4P08620 206 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CD53P19397 219 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1C1P21283 382 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FPR1P21462 350 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CRYGSP22914 178 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ALDH3A1P30838 453 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FRKP42685 505 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PDE7AQ13946 482 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 DUSP5Q16690 384 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MFSD12Q6NUT3 480 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 LRRN4CLQ8ND94 238 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 AGR3Q8TD06 166 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 UBTD1Q9HAC8 227 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MKS1Q9NXB0 559 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NTMQ9P121 344 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 AKAP6Q13023 2319 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 PIP5K1BO14986 540 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SMPD2O60906 423 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NUDT14O95848 222 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CHRNGP07510 517 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 BCKDHAP12694 445 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K8P41279 467 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 MLC1Q15049 377 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 CPTPQ5TA50 214 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZNF550Q7Z398 422 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GGNQ86UU5 652 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 STK32CQ86UX6 486 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 NATD1Q8N6N6 113 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ZNF527Q8NB42 609 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 WFDC11Q8NEX6 87 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 OR6K3Q8NGY3 331 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 OR10D3Q8NH80 312 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 FAM110BQ8TC76 370 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTB-212ENST00000484841 GIMAP5Q96F15 307 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms