RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	VPS26A	O75436	327 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF254	O75437	659 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA3	P12429	323 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	UQCRB	P14927	111 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RGR	P47804	291 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	OR3A4P	P47883	348 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	HSF2	Q03933	536 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF154	Q13106	437 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DPYS	Q14117	519 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	KCNJ11	Q14654	390 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	C12orf60	Q5U649	245 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF544	Q6NX49	715 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	SYVN1	Q86TM6	617 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	VASH2	Q86V25	355 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	STKLD1	Q8NE28	680 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM80	Q96HE8	168 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	CHD4	Q14839	1912 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RBM39-231	ENST00000477334	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		3.03	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ATRX	P46100	2492 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC7	Q96M83	1385 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	FAM74A7	A6NL05	159 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	HDAC3	O15379	428 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	AKR7A3	O95154	331 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	UGT1A3	P35503	534 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PTGFR	P43088	359 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	GNPDA1	P46926	289 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	IFNAR2	P48551	515 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TRPC1	P48995	793 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LIM2	P55344	173 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OSTN	P61366	133 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TRIP10	Q15642	601 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	IFNE	Q86WN2	208 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CEND1	Q8N111	149 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR2T33	Q8NG76	320 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PSMG2	Q969U7	264 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	HPDL	Q96IR7	371 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	MAGEB18	Q96M61	343 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	GALP	Q9UBC7	116 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	NCAPD2	Q15021	1401 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	OR7A17	O14581	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LANCL1	O43813	399 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SCGB2A1	O75556	95 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	STX11	O75558	287 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	SCRG1	O75711	98 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	LYPD3	O95274	346 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ANP32D	O95626	131 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CD55	P08174	381 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TSPY4	P0CV99	314 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	TSPY10	P0CW01	314 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	THRB	P10828	461 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	ZP3	P21754	424 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	CCND2	P30279	289 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	DIO3	P55073	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	STX17	P56962	302 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	RND3	P61587	244 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RBM39-231	ENST00000477334	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.01	□□□□□ -1.93

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