RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 CFL2Q9Y281 166 aa23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRGMA1A4Y4 181 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 COQ9O75208 318 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 NKX2-2O95096 273 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 OXA1LQ15070 435 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 LIPKQ5VXJ0 399 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 WDR88Q6ZMY6 472 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SEC14L4Q9UDX3 406 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH10Q9Y6N8 788 aa23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAOBP27338 520 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD38P28907 300 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD40LGP29965 261 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PGGHGQ32M88 737 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF554Q86TJ5 538 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHC2Q8IXK0 858 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PEX11GQ96HA9 241 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 STUB1Q9UNE7 303 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNK2O95069 426 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CRYBB2P43320 205 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAPZBP47756 277 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FASLGP48023 281 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDH11P55287 796 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FLYWCH1Q4VC44 716 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SHFQ7M4L6 423 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SAMD8Q96LT4 415 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASPNQ9BXN1 380 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 DPH1Q9BZG8 443 aa23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOXS1O43638 330 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PROS1P07225 676 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 NME1P15531 152 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 S1PR1P21453 382 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD27P26842 260 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 STX4Q12846 297 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR2G6Q5TZ20 316 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 GKN2Q86XP6 184 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR2T33Q8NG76 320 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PFN4Q8NHR9 129 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM239Q8WW34 195 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PMM1Q92871 262 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARSGQ96EG1 525 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TCTN2Q96GX1 697 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC38A3Q99624 504 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 GON4LQ3T8J9 2241 aa23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FUOMA2VDF0 154 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TAF4O00268 1085 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 WNT4P56705 351 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PSG6Q00889 435 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERV3-1Q14264 604 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 NIPAL1Q6NVV3 410 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 HSDL2Q6YN16 418 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF614Q8N883 585 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 RIT1Q92963 219 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLE3Q9NRF9 147 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PEX16Q9Y5Y5 336 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 METTL12A8MUP2 240 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FUT1P19526 365 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 GCGRP47871 477 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLAURQ03405 335 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 AADACL4Q5VUY2 407 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 CLDN22Q8N7P3 220 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 RFKQ969G6 155 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUAK2Q9H093 628 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 FOLH1BQ9HBA9 442 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 C20orf141Q9NUB4 165 aa23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM131Q92545 1883 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 A0A1W2PR77 199 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC119BA6NIH7 251 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 LYPD3O95274 346 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC2A10O95528 541 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 IFI30P13284 250 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR4N2Q8NGD1 307 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 GATAD2BQ8WXI9 593 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.41■■□□□ 1.34
PLEKHF1-201ENST00000436066 MED17Q9NVC6 651 aa23.41■■□□□ 1.34
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