RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7G2Q8NG99 324 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM159Q96B96 161 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX11GQ96HA9 241 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A5Q96R48 311 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM170BA6NMN3 283 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HCRTR1O43613 425 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HPGDSO60760 199 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GUSBP08236 651 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C6P13671 934 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A5P33763 92 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL3P39023 403 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL5Q5H9L2 206 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DDI2Q5TDH0 399 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PAQR7Q86WK9 346 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CPOQ8IVL8 374 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DPH7Q9BTV6 452 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK12Q9HB15 430 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CMAHPQ9Y471 501 aa3.37□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ARPC3O15145 178 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OGG1O15527 345 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NTHL1P78549 312 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF180Q86T96 592 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 LAPTM4BQ86VI4 370 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT73Q86Y46 540 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD7Q96MP8 289 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WACQ9BTA9 647 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0A6YYJ9 748 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 H7BY64 318 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 WISP1O95388 367 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT75O95678 551 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 AIFM1O95831 613 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DPB1P04440 258 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MELTFP08582 738 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFA1P59665 94 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFA3P59666 94 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TUSC1Q2TAM9 212 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CLLU1Q5K131 121 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DCST1Q5T197 706 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM65Q6PI78 240 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 HMGN2P46Q86SG4 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BBS10Q8TAM1 723 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OTUB2Q96DC9 234 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51I1Q9H343 314 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 CMC2Q9NRP2 79 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NOTOA8MTQ0 251 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FMO6PO60774 539 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RAF1P04049 648 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPIND1P05546 499 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PSKH1P11801 424 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 ICAM2P13598 275 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 MAKP20794 623 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP3R1P63098 170 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DGCR2P98153 550 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DECR1Q16698 335 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T4Q8NH00 348 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 FN3KQ9H479 309 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 DOK2O60496 412 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 NCR1O76036 304 aa3.36□□□□□ -1.87
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5F1O95221 314 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms