RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR52J3Q8NH60 311 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PSMF1Q92530 271 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 H3BN98 237 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RHCEP18577 417 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HTD2P86397 168 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF790Q6PG37 636 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LCLAT1Q6UWP7 414 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 BIVMQ86UB2 503 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR22Q99680 433 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DUSP16Q9BY84 665 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.26□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 WASH3PC4AMC7 463 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 J3KRW8 73 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEIS2O14770 477 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GLP2RO95838 553 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR8U8P0C7N1 319 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADORA3P0DMS8 318 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 S100A3P33764 101 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DMWDQ09019 674 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LINGO2Q7L985 606 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR8U1Q8NH10 309 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARL15Q9NXU5 204 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MEIS3P2A8K0S8 358 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARPC2O15144 300 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKACGP22612 351 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC6A1P30531 599 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPX6P59796 221 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF154Q13106 437 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAP2K5Q13163 448 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAB30Q15771 203 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PSG3Q16557 428 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 PNKDQ8N490 385 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 IPMKQ8NFU5 416 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SDSLQ96GA7 329 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MASTLQ96GX5 879 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SH2B3Q9UQQ2 575 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 C5P01031 1676 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LRRC37A3O60309 1634 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A1B0GVG6 124 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GOSR2O14653 212 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXC12P31275 282 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GCGRP47871 477 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 GSK3AP49840 483 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL2P60568 153 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MBTPS1Q14703 1052 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 LTB4RQ15722 352 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DCST1Q5T197 706 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 EXD3Q8N9H8 876 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NANPQ8TBE9 248 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 HAS1Q92839 578 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNH6Q9H252 994 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 APMAPQ9HDC9 416 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO34Q9NWN3 711 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 TIMM22Q9Y584 194 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 SCN7AQ01118 1682 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A1W2PS29 197 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MT-ND6P03923 174 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 F11P03951 625 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 MMP10P09238 476 aa3.25□□□□□ -1.89
PKHD1L1-201ENST00000378402 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms