RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 PACSIN3Q9UKS6 424 aa15.51■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.51■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.51■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.51■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 DOCK7Q96N67 2140 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OR2M5A3KFT3 312 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 C17orf51A8MQB3 221 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ESPNB1AK53 854 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 H3BML4 177 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SEC14L5O43304 696 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 HCRTR2O43614 444 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CTAG2O75638 210 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 IGKV1D-16P01601 117 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GALNT10Q86SR1 603 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SFXN5Q8TD22 340 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 COQ8BQ96D53 544 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 DUSP26Q9BV47 211 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PIGUQ9H490 435 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ASIC5Q9NY37 505 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 JKAMPQ9P055 326 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZNF175Q9Y473 711 aa15.5■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 B4DXG7 233 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 H3BNH8 94 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GMFGO60234 142 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 TNFRSF21O75509 655 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 C6orf47O95873 294 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 G6PDP11413 515 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZNF17P17021 662 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SLC1A6P48664 564 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 RPL14P50914 215 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 C21orf58P58505 322 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OCRLQ01968 901 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 FOXF2Q12947 444 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 FGFBP1Q14512 234 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SGCBQ16585 318 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PGS1Q32NB8 556 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CDC73Q6P1J9 531 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 APOOLQ6UXV4 268 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 LUZP2Q86TE4 346 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZNF781Q8N8C0 355 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OR4C3Q8NH37 302 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 FAM110BQ8TC76 370 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SMPDL3BQ92485 455 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 RTN4RQ9BZR6 473 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 HOXD1Q9GZZ0 328 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 VDAC3Q9Y277 283 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.49■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 A6NNC1 897 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ITM2AO43736 263 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GOSR1O95249 250 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 EPXP11678 715 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 FCGR2AP12318 317 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ME2P23368 584 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SOAT1P35610 550 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CLDN8P56748 225 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 STX3Q13277 289 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 HHATQ5VTY9 493 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GATSQ8NAP1 163 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CDS1Q92903 461 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PGM2Q96G03 612 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PINK1Q9BXM7 581 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 RASSF1Q9NS23 344 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SPG11Q96JI7 2443 aa15.48■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 A0A1W2PNV4 684 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 A0A1W2PQD3 144 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 MSTNO14793 375 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 ERLIN1O75477 346 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 TGM6O95932 706 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.47■□□□□ 0.07
USP11-202ENST00000377078 CPOXP36551 454 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms