RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NUP43Q8NFH3 380 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PIK3R3Q92569 461 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A6Q92581 669 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MOAP1Q96BY2 351 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GIMAP5Q96F15 307 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SFXN2Q96NB2 322 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DPY30Q9C005 99 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CALHM2Q9HA72 323 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HHATLQ9HCP6 504 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PNPOQ9NVS9 261 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NTMQ9P121 344 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 UBDO15205 165 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DIAPH2O60879 1101 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NKX2-2O95096 273 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-16P01601 117 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KRT16P08779 473 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KITP10721 976 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LAMP1P11279 417 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP24386 653 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 UQCRC1P31930 480 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K8P41279 467 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF136P52737 540 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DLX5P56178 289 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN8P56748 225 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN18P56856 261 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-9P60411 292 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SRYQ05066 204 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP5Q16690 384 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RAET1LQ5VY80 246 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT10Q86SR1 603 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 COX18Q8N8Q8 333 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR2M3Q8NG83 312 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 JADE3Q92613 823 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TESCQ96BS2 214 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC46Q96FV0 321 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF559Q9BR84 538 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DSN1Q9H410 356 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MED11Q9P086 117 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 L3MBTL1Q9Y468 752 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SNX8Q9Y5X2 465 aa6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRB8 838 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLCA1A8K7I4 914 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SDHDO14521 159 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZIC3O60481 467 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK2O95069 426 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL1O95841 491 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NGFRP08138 427 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ALOX5P09917 674 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 G6PDP11413 515 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF708P17019 499 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 HK1P19367 917 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN3P20807 821 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CTSSP25774 331 aa6.93□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA3P29320 983 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms