RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 MS4A15Q8N5U1 240 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 EID2Q8N6I1 236 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 NDNFQ8TB73 568 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 B3GNT2Q9NY97 397 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.08■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
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PTPRM-201ENST00000332175 RTP4Q96DX8 246 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 DRGXA6NNA5 263 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 LCKP06239 509 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CDK2P24941 298 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRM-201ENST00000332175 BMP4P12644 408 aa21.05■□□□□ 0.96
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