RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 MORN4Q8NDC4 146 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TSLPQ969D9 159 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A4Q969I6 547 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRC1Q96M27 445 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGDIGQ99819 225 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 APOL4Q9BPW4 351 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RP1P56715 2156 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC28Q96AY4 2481 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C76A6NM76 312 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 B4E171 279 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HRKO00198 91 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 BCKDKO14874 412 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10H3O60404 316 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MITFO75030 526 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP7B1O75881 506 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CLIC3O95833 236 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV3-11P04433 115 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CYC1P08574 325 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CD63P08962 238 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A8P0DMV1 189 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A9P0DMV2 189 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CCKBRP32239 447 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN7P41732 249 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP12AP54707 1039 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EMP2P54851 167 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC37A1P57057 533 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PSPHP78330 225 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 COX10Q12887 443 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KEAP1Q14145 624 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAM2Q15035 370 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF220Q5VTB9 566 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGN2P46Q86SG4 172 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LACC1Q8IV20 430 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MBOAT4Q96T53 435 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MCHR1Q99705 422 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RLIMQ9NVW2 624 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSFQ9UBX1 484 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM131Q92545 1883 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 IDSB3KWA1 339 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BNH8 94 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 FMO6PO60774 539 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ALOX12BO75342 701 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5F1O95221 314 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 DDAH2O95865 285 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPTM1O96005 669 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAP00813 363 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 GASTP01350 101 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CD59P13987 128 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 HPGDP15428 266 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 LCN1P31025 176 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT20P35900 424 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ESRRGP62508 458 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 RPP38P78345 283 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MYBPC1Q00872 1141 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 SPEM2Q0P670 501 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF141Q15928 474 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms