RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.77□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1SP09871 688 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FCRLAQ7L513 359 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 MFFQ9GZY8 342 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR52D1Q9H346 318 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NHSQ6T4R5 1651 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 A0A1B0GVI7 797 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C6P13671 934 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TLE2Q04725 743 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CCDC190Q86UF4 302 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PPL8 197 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 IGLON5A6NGN9 336 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 B8ZZF3 427 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LGALS8O00214 317 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 UBXN7O94888 489 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 RLN2P04090 185 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 M6PRP20645 277 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 BMPR1AP36894 532 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ARFRP1Q13795 201 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SGTBQ96EQ0 304 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PKMYT1Q99640 499 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.76□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 EMC8O43402 210 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GABRA5P31644 462 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR10A3P58181 314 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ENPP2Q13822 863 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GXYLT1Q4G148 440 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LIPIQ6XZB0 460 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 THAP4Q8WY91 577 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 BRF2Q9HAW0 419 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 DOK2O60496 412 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SCGB1D2O95969 90 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC6A6P31641 620 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TRIM23P36406 574 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 HCCSP53701 268 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OPCMLQ14982 345 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TCTE1Q5JU00 501 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 IFNL1Q8IU54 200 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 GHSRQ92847 366 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CHFRQ96EP1 664 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 Q9Y3F1 56 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 INHAP05111 366 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PTPN2P17706 415 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TOMM20Q15388 145 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SSX1Q16384 188 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 FAHD1Q6P587 224 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SEC22AQ96IW7 307 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TRIM2Q9C040 744 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 NOX3Q9HBY0 568 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.75□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TVP23AA6NH52 213 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TOR1AO14656 332 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 KLK8O60259 260 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 SMCO1Q147U7 214 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 TOR2AQ5JU69 321 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 APH1BQ8WW43 257 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 CMKLR1Q99788 373 aa14.74□□□□□ -0.05
USP43-201ENST00000285199 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms