RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-201ENST00000280780 GUSBP08236 651 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 CYP4B1P13584 511 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 FBXW4P57775 412 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PSPHP78330 225 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HPCAP84074 193 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 GPR68Q15743 365 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 IGFL2Q6UWQ7 119 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 EID3Q8N140 333 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 BEST3Q8N1M1 668 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 BBS10Q8TAM1 723 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 AGAP4Q96P64 663 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 CALML5Q9NZT1 146 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.51■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 A0A0G2JPF8 293 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 KDELR2P33947 212 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 GNA13Q14344 377 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MAPK14Q16539 360 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 LILRA2Q8N149 483 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SLC15A4Q8N697 577 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 OR4C3Q8NH37 302 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 POLE3Q9NRF9 147 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 M0QX08 132 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SUV39H1O43463 412 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ICOSLGO75144 302 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 F10P00742 488 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 OPN1SWP03999 348 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 IL12BP29460 328 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 VHLP40337 213 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SSR4P51571 173 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PNLIPRP2P54317 469 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MEP1AQ16819 746 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HGDQ93099 445 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 COL21A1Q96P44 957 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 LUZP4Q9P127 313 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.49■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 UGT2B17O75795 530 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 UTS2O95399 124 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ETS2P15036 469 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 NAGAP17050 411 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ATP6V1C1P21283 382 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SESN3P58005 492 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ISLR2Q6UXK2 745 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 TEX19Q8NA77 164 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 OR5M3Q8NGP4 307 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 FAM162AQ96A26 154 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PKP2Q99959 881 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 AGAP5A6NIR3 686 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ADAM10O14672 748 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ABCB7O75027 752 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MFN2O95140 757 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 KRT20P35900 424 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 DCTP40126 519 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 KLRB1Q12918 225 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 NTRK2Q16620 822 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 TBCELQ5QJ74 424 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 APOOLQ6UXV4 268 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 COMTD1Q86VU5 262 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ZNF227Q86WZ6 799 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 Q8NA96 180 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 OR10G3Q8NGC4 313 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ASB15Q8WXK1 588 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 NODALQ96S42 347 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 STMN3Q9NZ72 180 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM53B-201ENST00000280780 SERPINA1P01009 418 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms