RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235372.11

PRDM2-201, Transcript of PR/SET domain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM2, Length 7,957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2-201ENST00000235372 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.16□□□□□ -1.26
PRDM2-201ENST00000235372 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.16□□□□□ -1.26
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PRDM2-201ENST00000235372 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PRDM2-201ENST00000235372 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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PRDM2-201ENST00000235372 CRB3Q9BUF7 120 aa7.15□□□□□ -1.26
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PRDM2-201ENST00000235372 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.15□□□□□ -1.26
PRDM2-201ENST00000235372 KLBQ86Z14 1044 aa7.15□□□□□ -1.26
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PRDM2-201ENST00000235372 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.15□□□□□ -1.27
PRDM2-201ENST00000235372 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PRDM2-201ENST00000235372 ZNF566Q969W8 418 aa7.15□□□□□ -1.27
PRDM2-201ENST00000235372 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.15□□□□□ -1.27
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