RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ACTG1P63261 375 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF404Q494X3 552 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MOB3CQ70IA8 216 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 AAED1Q7RTV5 226 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 COMTD1Q86VU5 262 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 LMF1Q96S06 567 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC30A6NM36 301 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 UNC50Q53HI1 259 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.95□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 GAREM2Q75VX8 874 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 AIG1Q9NVV5 245 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 TAZQ16635 292 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 PXKQ7Z7A4 578 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 DPH1Q9BZG8 443 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 IL26Q9NPH9 171 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.94□□□□□ -0.82
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TRPS1-201ENST00000220888 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.94□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 HIDE1A8MVS5 230 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 UGDHO60701 494 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ADAP00813 363 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 KNG1P01042 644 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 AMY2AP04746 511 aa9.93□□□□□ -0.82
TRPS1-201ENST00000220888 ITGB2P05107 769 aa9.93□□□□□ -0.82
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