RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Noxo1Q8VCM2 349 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plet1Q8VEN2 237 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr689Q8VG18 320 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr535Q8VGL3 312 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc41a3Q921R8 488 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pbx4Q99NE9 378 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glipr1Q9CWG1 255 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cndp2Q9D1A2 475 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps33Q9D2R8 106 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr933Q9EQA0 308 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clca3a2Q9EQR4 902 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gde1Q9JL56 331 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ulk2Q9QY01 1037 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rasal1Q9Z268 799 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spag17Q5S003 2320 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HttP42859 3119 aa6.21□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21865A0A087WRL2 222 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13539A0A1B0GSM6 183 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11939A2A592 99 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint4A7TZF3 474 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm43720E0CXM8 267 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r98E9PZ56 857 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7951E9Q0A2 213 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6482F6YHC1 213 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17124F6ZIG1 213 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3327F7C9A1 213 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Galnt9G3X942 604 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh3b3J3QMK6 479 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hps1O08983 704 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mab21l1O70299 359 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tgfb3P17125 410 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TrhrP21761 393 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgf1P61148 155 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tamm41Q3TUH1 337 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BC030870Q3V2G4 71 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taar7aQ5QD12 358 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PmlQ60953 885 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lasp1Q61792 263 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CebpeQ6PZD9 281 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ScocQ78YZ6 125 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpina3fQ80X76 445 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spag1Q80ZX8 901 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slitrk4Q810B8 837 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc5a7Q8BGY9 580 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10330Q8BKS1 112 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C130079G13RikQ8BUY2 280 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mterf4Q8BVN4 346 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bloc1s5Q8R015 185 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp709Q8VC29 727 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr108Q8VFA1 320 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhga12Q91XY7 932 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sntg1Q925E1 517 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr6Q99ME2 1125 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnk1Q99ML2 666 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700029P11RikQ9CQ68 150 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IqchQ9D2K4 1071 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chp2Q9D869 196 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp6Q9DBB1 381 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem43Q9DBS1 400 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif3fQ9DCH4 361 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PaicsQ9DCL9 425 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndrg3Q9QYF9 375 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim3Q9R1R2 744 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13283A0A087WPG5 182 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esp22A8R0V4 111 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13271B1AYH9 182 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20547B8JJN0 1276 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r117K7N6V1 857 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajb3O35723 242 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fzd1O70421 642 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smpd2O70572 419 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CgaP01216 120 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CfbP04186 761 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il1r2P27931 410 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd63P41731 238 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabrb1P50571 474 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp41Q02526 198 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fads2p1Q0VAX3 487 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acss3Q14DH7 682 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rspo3Q2TJ95 277 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arntl2Q2VPD4 579 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Entpd7Q3TCT4 606 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itpripl2Q3UV16 535 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C130050O18RikQ497Y9 356 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xkr5Q5GH66 676 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd53Q61451 219 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ManeaQ6NXH2 462 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elp6Q8BK75 266 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RfkQ8CFV9 155 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TifabQ8JZM6 147 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aoc1Q8JZQ5 751 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlgap5Q8K4R9 808 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r206Q8R277 312 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr53Q8VGL8 312 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ScgnQ91WD9 276 aa6.2□□□□□ -1.42
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akr1c21Q91WR5 323 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.6 ms