RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636019.1

PRRT2-209, Transcript of proline rich transmembrane protein 2, human

TSL 5

Gene PRRT2, Length 131 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRRT2-209	ENST00000636019	SUSD4	Q5VX71	490 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	COPS6	Q7L5N1	327 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	MBIP	Q9NS73	344 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRRT2-209	ENST00000636019	ANP32C	O43423	234 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	FSTL1	Q12841	308 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	ANXA1	P04083	346 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	KRT24	Q2M2I5	525 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	HYPK	Q9NX55	129 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	NECTIN2	Q92692	538 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	CCDC27	Q2M243	656 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	NLRP3	Q96P20	1036 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	APLP1	P51693	650 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRRT2-209	ENST00000636019	NLRP10	Q86W26	655 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	PSMD1	Q99460	953 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	SNED1	Q8TER0	1413 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	MRS2	Q9HD23	443 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	LAMB2	P55268	1798 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	SCN4A	P35499	1836 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	IL16	Q14005	1332 aa		28.7	■■■□□ 2.19
PRRT2-209	ENST00000636019	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	GOLGA2	Q08379	1002 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	SYNE4	Q8N205	404 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	WWC1	Q8IX03	1113 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	JDP2	Q8WYK2	163 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	BBOX1	O75936	387 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	OLFM4	Q6UX06	510 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	ABCC4	O15439	1325 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
PRRT2-209	ENST00000636019	POTEC	B2RU33	542 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	FZD9	O00144	591 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	CACNA1F	O60840	1977 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	GRAP	Q13588	217 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	STK31	Q9BXU1	1019 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	GPC2	Q8N158	579 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	WDR63	Q8IWG1	891 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRRT2-209	ENST00000636019	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	FAM89A	Q96GI7	184 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRRT2-209	ENST00000636019	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16

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