RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 IL25Q9H293 177 aa20.68■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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GLIS1-202ENST00000628545 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 USP16Q9Y5T5 823 aa20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC93Q567U6 631 aa20.67■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 LARGE1O95461 756 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 NFE2L2Q16236 605 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.66■□□□□ 0.9
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GLIS1-202ENST00000628545 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.66■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.66■□□□□ 0.9
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GLIS1-202ENST00000628545 ZNF853P0CG23 659 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 TDO2P48775 406 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 KRT85P78386 507 aa20.65■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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GLIS1-202ENST00000628545 GORABQ5T7V8 394 aa20.64■□□□□ 0.9
GLIS1-202ENST00000628545 MCTP2Q6DN12 878 aa20.64■□□□□ 0.9
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GLIS1-202ENST00000628545 CEP89Q96ST8 783 aa20.6■□□□□ 0.89
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GLIS1-202ENST00000628545 NR1I2O75469 434 aa20.59■□□□□ 0.89
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GLIS1-202ENST00000628545 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.59■□□□□ 0.89
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GLIS1-202ENST00000628545 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.58■□□□□ 0.88
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GLIS1-202ENST00000628545 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 SGSM3Q96HU1 749 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.58■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 SPATA32Q96LK8 384 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 HYPKQ9NX55 129 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 STK26Q9P289 416 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 KIF1BO60333 1816 aa20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 MROH2AA6NES4 1674 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 CORO7P57737 925 aa20.56■□□□□ 0.88
GLIS1-202ENST00000628545 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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