RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621269.4

ATXN3-253, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-253	ENST00000621269	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	CFAP44	Q96MT7	982 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	WDR90	Q96KV7	1748 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	POTEC	B2RU33	542 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ATXN3-253	ENST00000621269	HOXB7	P09629	217 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	NLRP3	Q96P20	1036 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	APAF1	O14727	1248 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	HTRA3	P83110	453 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	PSMD1	Q99460	953 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ATXN3-253	ENST00000621269	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	GNAI1	P63096	354 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	IFT57	Q9NWB7	429 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF853	P0CG23	659 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	HYPK	Q9NX55	129 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	SNED1	Q8TER0	1413 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	FZD9	O00144	591 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	CHADL	Q6NUI6	762 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	KLRG1	Q96E93	195 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ATXN3-253	ENST00000621269	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ABCC4	O15439	1325 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	BBOX1	O75936	387 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	GPC2	Q8N158	579 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	HACL1	Q9UJ83	578 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	POTEI	P0CG38	1075 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	POTEJ	P0CG39	1038 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATXN3-253	ENST00000621269	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC51A	Q86UW1	340 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	LDHD	Q86WU2	507 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	SCN4A	P35499	1836 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	SP8	Q8IXZ3	490 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	EPHX2	P34913	555 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	GRAP	Q13588	217 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
ATXN3-253	ENST00000621269	COL4A5	P29400	1685 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	AOC3	Q16853	763 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	MPND	Q8N594	471 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	LAMB2	P55268	1798 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	ANP32C	O43423	234 aa		31	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31	■■■□□ 2.55
ATXN3-253	ENST00000621269	TMC4	Q7Z404	712 aa		31	■■■□□ 2.55

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