RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 KAT6BQ8WYB5 2073 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRMP28827 1452 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRCP08575 1304 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 CNPY4Q8N129 248 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 IL25Q9H293 177 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 F13A1P00488 732 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 ORAI2Q96SN7 254 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF853P0CG23 659 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K11Q16584 847 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 ABTB2Q8N961 1025 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.65□□□□□ -0.86
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PTPRT-211ENST00000618610 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 RAD50Q92878 1312 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 LARGE1O95461 756 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 DACT1Q9NYF0 836 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-211ENST00000618610 PACS2Q86VP3 889 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 BANK1Q8NDB2 785 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 FAM212AQ96EL1 285 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC69A6NI79 296 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PPFIA3O75145 1194 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MCCP23508 829 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CHRNA2Q15822 529 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CEP85Q6P2H3 762 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRT-211ENST00000618610 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TNMDQ9H2S6 317 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF165P49910 485 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 HMMRO75330 724 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SASH3O75995 380 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRT-211ENST00000618610 YY1AP1Q9H869 796 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3C2BO00750 1634 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MCM2P49736 904 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SRLQ86TD4 932 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PTCH1Q13635 1447 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.63□□□□□ -0.87
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PTPRT-211ENST00000618610 NECAB1Q8N987 351 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ATG3Q9NT62 314 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GJB2P29033 226 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRT-211ENST00000618610 PDE1AP54750 535 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TPM4P67936 248 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MSH6P52701 1360 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRT-211ENST00000618610 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GUCY2CP25092 1073 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 HOMER1Q86YM7 354 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 STK31Q9BXU1 1019 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 LGR6Q9HBX8 967 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MED14O60244 1454 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 UBXN4Q92575 508 aa9.61□□□□□ -0.87
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