RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617229.1

GTSE1-AS1-201, humanhuman

Gene GTSE1-AS1, Length 306 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 APAF1O14727 1248 aa20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 IFT57Q9NWB7 429 aa20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CRY2Q49AN0 593 aa20.46■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SUSD4Q5VX71 490 aa20.46■□□□□ 0.87
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.45■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PDIA6Q15084 440 aa20.45■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 JDP2Q8WYK2 163 aa20.45■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.44■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.44■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.44■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.44■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TCIRG1Q13488 830 aa20.43■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.43■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.43■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 MBIPQ9NS73 344 aa20.43■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 NTSR2O95665 410 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ANXA1P04083 346 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 GOLGA2Q08379 1002 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PROSER3Q2NL68 480 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.42■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.41■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PSMD1Q99460 953 aa20.41■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ABCC12Q96J65 1359 aa20.41■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 MRS2Q9HD23 443 aa20.4■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.39■□□□□ 0.86
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 BBOX1O75936 387 aa20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 NLRP10Q86W26 655 aa20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SYNE4Q8N205 404 aa20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PRELPP51888 382 aa20.38■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 KRT24Q2M2I5 525 aa20.38■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TMC4Q7Z404 712 aa20.38■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 WDR90Q96KV7 1748 aa20.38■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ZNF853P0CG23 659 aa20.37■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 STK31Q9BXU1 1019 aa20.37■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 VPS33BQ9H267 617 aa20.37■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CCDC27Q2M243 656 aa20.36■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.35■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.34■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SCN4AP35499 1836 aa20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CHADLQ6NUI6 762 aa20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 NIM1KQ8IY84 436 aa20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 GPC2Q8N158 579 aa20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 HACL1Q9UJ83 578 aa20.33■□□□□ 0.85
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SP8Q8IXZ3 490 aa20.32■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 FZD9O00144 591 aa20.31■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.31■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 GRAPQ13588 217 aa20.31■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 OLFM4Q6UX06 510 aa20.31■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ABCC4O15439 1325 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 IL16Q14005 1332 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 PPIP5K2O43314 1243 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 LDHDQ86WU2 507 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 MPNDQ8N594 471 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.3■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 WWC1Q8IX03 1113 aa20.29■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.28■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 FAM89AQ96GI7 184 aa20.28■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.28■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 POTECB2RU33 542 aa20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 EPHX2P34913 555 aa20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 MYD88Q99836 296 aa20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
GTSE1-AS1-201ENST00000617229 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms