RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616545.4

TARDBP-217, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TARDBP, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-217ENST00000616545 NYXQ9GZU5 481 aa14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.62□□□□□ -0.07
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TARDBP-217ENST00000616545 NUP98P52948 1817 aa14.62□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 GYS1P13807 737 aa14.61□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.61□□□□□ -0.07
TARDBP-217ENST00000616545 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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TARDBP-217ENST00000616545 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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TARDBP-217ENST00000616545 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.48□□□□□ -0.09
TARDBP-217ENST00000616545 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TARDBP-217ENST00000616545 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TARDBP-217ENST00000616545 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.48□□□□□ -0.09
TARDBP-217ENST00000616545 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.48□□□□□ -0.09
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TARDBP-217ENST00000616545 COPRSQ9NQ92 184 aa14.48□□□□□ -0.09
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