RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-230ENST00000600058 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-230ENST00000600058 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
FCHO1-230ENST00000600058 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.51■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 ABHD8Q96I13 439 aa22.5■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 SCNN1DP51172 638 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.48■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 NGEFQ8N5V2 710 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.47■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 PPP2R1AP30153 589 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 EPS15P42566 896 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 CAPNS2Q96L46 248 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.46■■□□□ 1.19
FCHO1-230ENST00000600058 ECE1P42892 770 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.45■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.44■■□□□ 1.18
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FCHO1-230ENST00000600058 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 GPTP24298 496 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 SUSD4Q5VX71 490 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 CST9Q5W186 159 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 NIM1KQ8IY84 436 aa22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 TRAF5O00463 557 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 SLC51AQ86UW1 340 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 NTSR2O95665 410 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 MYL6BP14649 208 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 GRM1Q13255 1194 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 FAM161AQ3B820 660 aa22.4■■□□□ 1.18
FCHO1-230ENST00000600058 PPIP5K2O43314 1243 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.39■■□□□ 1.17
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FCHO1-230ENST00000600058 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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FCHO1-230ENST00000600058 SLC34A2O95436 690 aa22.38■■□□□ 1.17
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FCHO1-230ENST00000600058 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 ERBB4Q15303 1308 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 NEFMP07197 916 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 AOC3Q16853 763 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 PARP10Q53GL7 1025 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 NLRP3Q96P20 1036 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.37■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 AOC2O75106 756 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 CXCL9Q07325 125 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.34■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC4O15439 1325 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 LAMB2P55268 1798 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 CA12O43570 354 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 RGS19P49795 217 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-230ENST00000600058 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.33■■□□□ 1.16
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FCHO1-230ENST00000600058 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 BBOX1O75936 387 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-230ENST00000600058 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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