RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597020.5

AP2S1-204, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP2S1, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-204ENST00000597020 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.42■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 ERBB4Q15303 1308 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 MYL6BP14649 208 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 NFE2L2Q16236 605 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 CNTROBQ8N137 903 aa23.41■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.4■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.4■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 ABCC12Q96J65 1359 aa23.4■■□□□ 1.34
AP2S1-204ENST00000597020 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.39■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 FOXN1O15353 648 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 GPTP24298 496 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 VEGFBP49765 207 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.38■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 SNED1Q8TER0 1413 aa23.37■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 PARP10Q53GL7 1025 aa23.37■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.37■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.37■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 SUSD4Q5VX71 490 aa23.36■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 NLRP3Q96P20 1036 aa23.36■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.35■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.35■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 RASSF10A6NK89 507 aa23.35■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 VPS33BQ9H267 617 aa23.35■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 NIM1KQ8IY84 436 aa23.34■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 NTSR2O95665 410 aa23.33■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 WBP1LQ9NX94 342 aa23.33■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.33■■□□□ 1.33
AP2S1-204ENST00000597020 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.32■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.32■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 LAMB2P55268 1798 aa23.31■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 LTBP1Q14766 1721 aa23.3■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 PPIP5K2O43314 1243 aa23.3■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.3■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 COL4A5P29400 1685 aa23.29■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 ECE1P42892 770 aa23.29■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.29■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.29■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.29■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 EPS15P42566 896 aa23.28■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 SCNN1DP51172 638 aa23.28■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 RIPK4P57078 832 aa23.28■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 BBOX1O75936 387 aa23.27■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 LBX1P52954 281 aa23.27■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.27■■□□□ 1.32
AP2S1-204ENST00000597020 AOC3Q16853 763 aa23.25■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 PDIA6Q15084 440 aa23.24■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 SP8Q8IXZ3 490 aa23.24■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.24■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 ABCC4O15439 1325 aa23.24■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 MPNDQ8N594 471 aa23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.23■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.22■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.22■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 CAPNS2Q96L46 248 aa23.22■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 TAF1P21675 1872 aa23.22■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 TNIP1Q15025 636 aa23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 RALBP1Q15311 655 aa23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 COPS6Q7L5N1 327 aa23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 TMC4Q7Z404 712 aa23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.21■■□□□ 1.31
AP2S1-204ENST00000597020 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 CXCL9Q07325 125 aa23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 TCIRG1Q13488 830 aa23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 ANXA1P04083 346 aa23.19■■□□□ 1.3
AP2S1-204ENST00000597020 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms