RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 NBPF26B4DH59 902 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 GRM1Q13255 1194 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 NBPF15Q8N660 670 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 PRKAR2BP31323 418 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 FAM177BA6PVY3 158 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 CA12O43570 354 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 ABCC12Q96J65 1359 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 HLFQ16534 295 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 SLC51AQ86UW1 340 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 HHIPL1Q96JK4 782 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-211ENST00000592658 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 MCM10Q7L590 875 aa17.69■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CFAP44Q96MT7 982 aa17.69■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.68■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 NYXQ9GZU5 481 aa17.68■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.68■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 DGKZQ13574 1117 aa17.67■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.67■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.66■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 DCTN1Q14203 1278 aa17.66■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 NIM1KQ8IY84 436 aa17.66■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CFAP53Q96M91 514 aa17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 NUP98P52948 1817 aa17.65■□□□□ 0.42
CTIF-211ENST00000592658 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 VPS33BQ9H267 617 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.64■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 PPIP5K2O43314 1243 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 CXCL9Q07325 125 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 AOC3Q16853 763 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ZIC5Q96T25 663 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 UBN2Q6ZU65 1347 aa17.63■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 C3orf67Q6ZVT6 689 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 NUDCQ9Y266 331 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.62■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 NOGQ13253 232 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17.61■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 SUSD4Q5VX71 490 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.6■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 NTSR2O95665 410 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 PPP2R1AP30153 589 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 TTLL7Q6ZT98 887 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ZNF34Q8IZ26 560 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 NGEFQ8N5V2 710 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ZNF408Q9H9D4 720 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.59■□□□□ 0.41
CTIF-211ENST00000592658 GPTP24298 496 aa17.58■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.58■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 SAGE1Q9NXZ1 904 aa17.57■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 SOX10P56693 466 aa17.56■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 HUNKP57058 714 aa17.56■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.56■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.56■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.56■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 ABCC4O15439 1325 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 SHTN1A0MZ66 631 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 RAD17O75943 681 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.55■□□□□ 0.4
CTIF-211ENST00000592658 DLK2Q6UY11 383 aa17.55■□□□□ 0.4
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