RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PTPRS-209	ENST00000591760	PRELP	P51888	382 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	KIF3C	O14782	793 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC93	Q567U6	631 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	NLRP10	Q86W26	655 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	IL16	Q14005	1332 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PTPRS-209	ENST00000591760	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	GOLGA2	Q08379	1002 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	LAMB2	P55268	1798 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	TSPYL6	Q8N831	410 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	GLTPD2	A6NH11	291 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	33.2	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PTPRS-209	ENST00000591760	TOMM70	O94826	608 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR63	Q8IWG1	891 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	OLFM4	Q6UX06	510 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	RRAGC	Q9HB90	399 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	SNED1	Q8TER0	1413 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	SYNE4	Q8N205	404 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PTPRS-209	ENST00000591760	PSMD1	Q99460	953 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	WDR90	Q96KV7	1748 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	ABCC4	O15439	1325 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM89A	Q96GI7	184 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	HSPA6	P17066	643 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	MYD88	Q99836	296 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PTPRS-209	ENST00000591760	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	BBOX1	O75936	387 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	GRAP	Q13588	217 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	CACNA1F	O60840	1977 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	FSTL1	Q12841	308 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	JDP2	Q8WYK2	163 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP350	Q5VT06	3117 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PTPRS-209	ENST00000591760	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	TMC4	Q7Z404	712 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC51A	Q86UW1	340 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SP8	Q8IXZ3	490 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRS-209	ENST00000591760	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87

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