RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.66■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.66■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 C21orf2O43822 256 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.65■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 RASSF7Q02833 373 aa25.64■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.64■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.64■■□□□ 1.7
EFTUD2-217ENST00000590124 NFKBIEO00221 500 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 GOLGA2Q08379 1002 aa25.63■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 LAMB2P55268 1798 aa25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 PRELPP51888 382 aa25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 VAMP4O75379 141 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 STK31Q9BXU1 1019 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.61■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 ALDH1B1P30837 517 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 SYNE4Q8N205 404 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF181Q9P0P0 153 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.6■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 SOGA3Q5TF21 947 aa25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.59■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 CACNA1FO60840 1977 aa25.58■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 LMNB1P20700 586 aa25.58■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 NLRP3Q96P20 1036 aa25.58■■□□□ 1.69
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC4A2P04920 1241 aa25.57■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 G2E3Q7L622 706 aa25.57■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF428Q96B54 188 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 KSR2Q6VAB6 950 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 MYD88Q99836 296 aa25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 SNED1Q8TER0 1413 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC93Q567U6 631 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 OLFM4Q6UX06 510 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 MIER1Q8N108 512 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM89AQ96GI7 184 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.54■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.52■■□□□ 1.68
EFTUD2-217ENST00000590124 FLIIQ13045 1269 aa25.51■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC4O15439 1325 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 E9PSI1 815 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 IGKV5-2P06315 115 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.49■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 SLFN5Q08AF3 891 aa25.48■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.48■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC51AQ86UW1 340 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 TAF1P21675 1872 aa25.47■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF3CO14782 793 aa25.46■■□□□ 1.67
EFTUD2-217ENST00000590124 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 PSMD1Q99460 953 aa25.45■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 BBOX1O75936 387 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 GRAPQ13588 217 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.44■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 COL4A1P02462 1669 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 C1QTNF8P60827 252 aa25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms